研基于EFNB2 基与精神分裂症样本关联
研基于EFNB2 基与精神分裂症样本关联 1.引言 精神分裂症在人群中大约有1%的发病率,表现为错觉,幻觉,认知改变, 情绪激动和行为异常。在已知各种致病因素中,遗传因素大约占据了80%的作用, 表现为多个微效基因共同作用的结果。为了进一步研究EFNB2 基因座位在精神分裂症中的易感性,我们使用中 国汉族人的病例-对照样本,在该基因所在区域选取了几个SNPs,进行遗传标记 的单位点,多位点和单倍型的遗传分析。
2.材料和方法 2.1 研究对象 此研究得到地方精神病研究道德伦理委员会的支持并且得到所有研究对象 的同意。
所有的研究对象都是汉族血统。中国医学论文网专业提供医学论文发表服 务,并提供大量医学毕业论文,如有业务需求请咨询网站客服人员! 2.2 基因分型 我们使用等位基因特异性PCR 的方法进行基因分型,这种方法在其他研 究中已有报道。PCR 引物由tetra-primer ARMS-PCR 引物设计程序设计。引物序 列。
为了确定所获的基因型的正确性,我们随机选了80 个DNA 样本对这三 个SNPs 再次进行基因分型。所有的基因型都与第一次的基因分型结果一致,未 发现基因分型错误。
2.3 数据分析 使用 Hwsim 软件程序对三个SNPs 进行哈迪-温伯格平衡检验。对于病例- 对照组,运用Epi_Info 软件程序对遗传标记的等位基因分布进行卡方检验。使用 2LD 软件程序计算出D’值,以衡量两两SNPs 之间的连锁不平衡程度,从而构建 单倍型。使用PHASE 程序的2.2版本模拟各种单倍型频率。Bonferroni 校正被用于进行各项统计结果的校正。使用G*Power程序进行统计效力计算,当设置参数 为0.2 时(代表基因作用“微效”),当前使用的样本数量对于关联研究而言,具 有89%的统计效力。
3.结果 4.讨论 我们的样本中,遗传标记rs9520087 和精神分裂症之间显着相关,但对这 个结果我们保持谨慎的态度,因为在我们的样本中发现遗传标记rs9520087 背离 了哈迪-温伯格平衡(P0.05)。但对于遗传标记rs9520087 的背离,至少从三个方面 看来都不是一种假阳性结果。
此外,我们还发现遗传标记rs9520087 的等位基因频率在对照组中为0.323。
这与HapMap数据库中报道的0.663 存在很大的不同。这种差异可能是由于各自 相对较小的样本数量引起的,即dbSNP 为84 人,我们的样本量为369 人。当前 对于此现象还不能给出很好的解释,未来随着更多研究报道的出现,会有更多中 国汉族人的数据报道,那时再来探讨二者的正误可能更为合适。另一个方面,尽 管我们在研究中没有发现任何基因分型的错误,但是基因分型的错误依然不能完 全避免。
当然,仅仅从单个 SNP 位点分析而得到的信息是有限的。因此,为了获 得更加有力的证据,我们又进行了单倍型分析。而单倍型分析是在遗传标记之间, 利用连锁的有关信息进行的。
还需要指出的是,本项研究中我们在EFNB2 基因上选择了数个SNP 位点, 而没有选择全部的SNP 位点。这种选择可能使这些SNP 位点的分析结果被认为 不具有代表性。此外,我们从不同性别对等位基因和单倍型频率进行了分析,尽 管结果显示在男性和女性中存在一定的差异,但是这种统计分析尚不足以说明与 性别有关的遗传机制。
综上所述,我们的研究为EFNB2 基因与精神分裂症之间的关联提供了证 据支持。由于精神分裂症和其他复杂性遗传疾病在关联研究方面的复杂模式,还 需要用不同的人群样本进行更为深入和广泛的研究与验证。未来关于EFNB2 基 因和其他候选基因的研究将会更好的阐明NMDA 受体途径在精神分裂症的发病 机制中的作用。