为适应社会主义市场经济的要求，建立“产权清晰、权责明确、政企分开、管理科学”的现代企业制度，县委、县人民政府对县国有企业改革工作统一部署。根据部署县医药公司通过多方征询意见建议制定了改制方案。http://www.yytv.com.cn，办公人员公同的天地www.yytv.com.cn.com
改制方案确定的改制目标是：
１、通过改革，实现企业经营机制的转换，建立起产权清晰、权责明确、管理科学的现代企业制度，使新公司真正成为自主经营、自负盈亏、自我发展、自我约束的法人实体和市场竞争主体，为振兴文山医药经济作出新的贡献。
２、通过改革，先置换在职职工的身份，进一步确立企业职工的主人翁地位，充分调动广大职工的积极性和创造性，使广大职工真正成为企业的所有者和经营者。
３、通过改革，盘活企业存量资产，调整企业负债结构，实现企业转机建制的目标。
４、通过改革，建立适应市场经济要求的、符合新公司实际的内部管理体系。以提高经济效益为中心，以优质服务为宗旨，不断扩大经营规模，加强管理，降低成本，使投资者获得更大的利益。
改制方案确定的原则是：
１、根据国家有关规定，以企业净资产置换职工身份，实行经济补偿，并以补偿额为资本来源之一，按照经营者持大股的原则组建有限责任公司。
２、按照“先终止，后重组”的原则，先终止原企业法人实体，重新组建“文山县医药有限责任公司”（以下简称新公司）。
３、终止国有企业职工身份，解除与原企业签订的劳动合同，按照职工自愿的原则吸收原企业职工加入新公司，重新签订劳动合同。
改制工作按照“先终止，后重组”的原则，实行整体式改制，终止原国有企业“文山县医药公司”的法人资格，解除国有企业职工身份，在此基础上，按照经营者持大股的原则，吸纳原职工和其他社会投资者以职工安置费、增资扩股等形式，运用全部有效资产和负债，组建“文山县医药有限责任公司”。
改制后，原企业的一切债权由新公司享有，一切债务由新公司承担。未纳入改制的待处理财产损失，由县医药公司列出清单报县国资委办理相关手续.
根据《公司法》的规定，制定《文山县医药有限责任公司章程》，公司设立股东会、董事会和监事会，建立包括股东大会、董事会、监事会和经理层在内的公司治理结构，形成相互协调，相互制衡的机制，按《公司法》要求规范运作。
同时，新公司设立党组织、工会、女工委和团组织等机构，开展正常工作。
改制方案还对社会保险、安置费管理，离退休职工安置费支付，需配套的政策措施等提出详细的办法和措施。